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AI 新方法突破最難數學難題!賓州大學「光滑層」技術有望解鎖 DNA 奧祕

科技新報

更新於 2天前 • 發布於 1天前

美國賓州大學工程學院團隊近日公布突破性成果,開發更聰明的人工智慧,專門求解科學界公認最棘手的數學問題之一:逆向偏微分方程(inverse partial differential equations,PDEs)。論文刊登於《機器學習研究彙刊》(TMLR),並今年神經訊息處理系統大會(NeurIPS)發表。

什麼是逆向偏微分方程?

偏微分方程是科學建模的核心工具,描述系統如何隨時間與空間演變,廣泛應用於天氣預測、熱傳導、化學反應乃至DNA組織結構的研究。而「逆向」版本的挑戰則更艱鉅,不是從已知規則預測結果,而是從觀測到現象出發,回推算出背後隱藏的驅動力。

領導此研究的材料科學與工程系講席教授Vivek Shenoy以一個生動比喻說明:「解逆向問題就像看著池塘的漣漪,倒推出石子落水的位置。你能清楚看到效果,但真正的挑戰是推斷隱藏的原因。」

傳統AI方法的瓶頸

目前主流AI系統在處理這類問題時,採用一種稱為「遞迴自動微分」(recursive automatic differentiation)的數學運算。這個方法透過神經網路反覆計算數值變化,然而在面對複雜系統與含有雜訊的數據時,極容易出現計算不穩定的問題,且需要消耗大量算力。研究員比喻為「不斷放大一條粗糙曲線」,每次放大都會讓誤差加倍,最終讓結果失去可靠性。

多數AI進步依賴算力擴張,但此研究另闢蹊徑。博士候選人Vinayak Vinayak指出:「有些科學難題需要的是更好的數學,而不只是更多算力。」

創新「光滑層」解法

團隊找到靈感,源自1940年代數學家Kurt Otto Friedrichs提出的「mollifier」(柔化函數)概念,用來平滑不規則或含雜訊函數的數學工具。研究員將這個概念轉化為AI模型的「mollifier layer」(光滑層)。這個新增的網路層,計算微分之前先對輸入數據進行平滑處理,從根本上消除了傳統方法因雜訊累積造成的不穩定問題。

另一位共同第一作者Ananyae Kumar Bhartari表示,團隊最初以為問題出在神經網路架構,但深入研究後才發現,瓶頸其實是遞迴自動微分本身。引入平滑層後,不僅顯著降低了數據雜訊,也大幅減少了求解這些方程式所需的計算資源。

解鎖DNA奧祕的潛力

這項技術最令人矚目的應用潛力,在於基因研究領域。細胞核內的染色質(chromatin),亦即DNA與蛋白質摺疊後的複雜結構,決定了哪些基因被開啟或關閉,深刻影響細胞身分、功能、老化與疾病發展。

Shenoy教授表示,團隊長期致力於解析染色質如何在細胞內自我組織,但始終無法可靠地從數據反推出驅動這個系統的表觀遺傳過程。新方法有望改變這一局面,透過估算控制基因活動的表觀遺傳反應速率,科學家不僅能觀察染色質結構,更能預測它隨時間的演變。

Vinayak進一步指出:「如果我們能追蹤這些反應速率在老化、癌症或發育過程中的變化,就有可能開發出全新療法,若反應速率決定了細胞命運,那麼改變這些速率或許就能引導細胞轉變成理想的狀態。」

影響遠超生物學

研究員強調,平滑層的應用潛力遠不只遺傳學,材料科學、流體力學等涉及複雜方程與雜訊數據的領域,都可能從這套更穩定、更高效的框架中受益。

Shenoy總結研究的核心願景:「最終目標是從觀察複雜模式,進化到量化地揭示生成這些模式的規則。一旦理解了系統的運作規則,我們就擁有了改變它的可能。」

(首圖來源:Penn Engineering

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